Dagli anni Novanta revisione completa dei vecchi scavi; nel 1996 e nel 2008 interventi stratigrafici; nel 2008 nuovo percorso didattico e riallestimento delle vetrine dell’Antiquarium dell’Area archeologicaposta sotto il sagrato del Duomo
“L’abitato, la necropoli, il monastero”
Scavi nei cortili dell’Università Cattolica dal 1996 al 2004; risalgono al 2015 il nuovo percorso didattico e l’allestimento delle vetrine nell’aula Bontadini con i reperti degli scavi
Basilica di Sant’Eustorgio
Nel 2014 completamento del percorso didattico dell’area archeologica (necropoli) musealizzata sotto la basilica di Sant’Eustorgio, con i resti della necropoli
Teatro romano
Nel 2005 sondaggi stratigrafici condotti nella porzione di edificio conservata in Via Meravigli (Palazzo Turati); nel 2007 inaugurazione del nuovo percorso didattico “Museo Sensibile del Teatro Romano”, con diversificata offerta didattica
Basilica di San Lorenzo
Dal 2014 ad oggi studio dei materiali conservati nei matronei della basilica di San Lorenzo; nel 2015 inaugurazione del nuovo percorso didattico e dell’allestimento delle vetrine nella cappella di Sant’Aquilino